Iako Direkcija za avijaciju BiH nije prekoracila odobreni budžet za 2003. godinu, državni revizori primijetili su da se javni novac nije trošio ekonomicno, da su neke stavke iz budžeta prekoracene, te da je bilo niz nepravilnosti. Direkcija za avijaciju ostvaruje prihode i od preleta aviona preko teritorije BiH. Prema revizorskom izvještaju, tokom 2003. godine od 1,6 miliona, koliko je ostvareno na ovaj nacin, potrošeno je 1,1 milion KM. Revizori su ocijenili da je ovaj novac trošen "bez definis .....