Sarajevska hagada ponovo je došla u opasnost, i to možda najvecu do tada, tokom ratnih zbivanja koja su zahvatila Bosnu i Hercegovinu 1992. Kako je rat docekao nepripremljenu zemlju i narod, ni muzejske institucije, medu kojima i Zemaljski muzej, nisu stigle ništa uciniti za zaštitu svoga blaga. U tom pogledu najkriticnije je bilo upravo u Zemaljskom muzeju kako zbog položaja gdje se nalaze njegove zgrade, tako i zbog velikog broja eksponata (više od 1.700.000), izloženi u brojnim dvoranama ceti .....